Ecole Doctorale
BIOLOGIE SANTE
de Lille

Faculté de Médecine
Pôle Recherche
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59045 Lille cedex - France
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Fax (+33) 320 623 428
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Calendrier - Soutenances de thèse

USTL (USTL)
MAMIGONIAN BESSA Luíza  envoyer un message
mardi 21 novembre 2017
(14h00) - Amphithéâtre de l'IEMN à Lille 1
Investigation de l'ARN polymérase du virus de l'hépatite C en solution par résonance magnétique nucléaire et son interaction avec le domaine 2 de la protéine NS5A
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8576 éq. 02 (RMN ET INTERACTION MOLÉCULAIRE)
directeur de thèse : Xavier HANOULLE
 
USTL (USTL)
GILORMINI Pierre-andre  envoyer un message
mardi 21 novembre 2017
(14h00) - USTL Amphi CCHB, Haute Borne
Nouvelles stratégies chimiques pour la visualisation et la compréhension des mécanismes de sialylation
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8576 éq. 01 (GLYCOBIOLOGIE STRUCTURALE DES INTERACTION HÔTES-PATHOGÈNES)
directeur de thèse : Christophe BIOT
 
USTL (USTL)
DUPRET Barbara  envoyer un message
mercredi 22 novembre 2017
(14h00) - A préciser
Etude du rôle des protéines Polycomb Pcgf1 et Ezh2 chez le poisson-zèbre Danio rerio
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U908 (PLASTICITÉ CELLULAIRE ET CANCER)
directeur de thèse : Pierre-Olivier ANGRAND
 
LILLE 2 (MED)
DUPONT Clément  envoyer un message
vendredi 24 novembre 2017
(14h00) - Fac. de Méd. - Pôle formation - Salle de thèse 3
Thérapies photodynamiques appliquées aux gliomes de haut grade : de la théorie à la réalité clinique
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1189 (THÉRAPIES LASERS ASSISTÉES PAR L'IMAGE ET LA SIMULATION EN ONCOLOGIE (TLAI-ONCO))
directeur de thèse : Maximilien VERMANDEL
 
USTL (USTL)
WYCHOWSKI Adeline  envoyer un message
jeudi 30 novembre 2017
(14h30) - USTL Amphithéâtre IRI
Dynamique enzymatique et contrôle de la formation et de la distribution des branchements de l'amidon
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8576 éq. 11 (GLYCOBIOLOGIE VÉGÉTALE)
directeur de thèse : Fabrice WATTEBLED
 
LILLE 2 (STAPS)
CHEHERE Baptiste  envoyer un message
vendredi 01 décembre 2017
(14h00) - FSSEP Amphi 4
Impact d'une réhabilitation respiratoire et d'un suivi en activités physiques adaptées chez des patients atteints de pneumopathies interstitielles diffuses fibrosantes
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA7369 éq. 01 (ACTIVITÉ PHYSIQUE, MUSCLE, SANTÉ (APMS))
directeur de thèse : Valerie BOUGAULT
 
LILLE 2 (MED)
MOULIN Solene  envoyer un message
vendredi 01 décembre 2017
(16h00) - Fac. de Médecine - Pôle Formation - Salle des thèses
Pronostic à long terme des hémorragies intra-cérébrales 
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1171 (TROUBLES COGNITIFS DÉGÉNÉRATIFS ET VASCULAIRES)
directeur de thèse : Charlotte CORDONNIER
 
LILLE 2 (MED)
DA COSTA GOUVEIA Joana  envoyer un message
vendredi 01 décembre 2017
(15h00) - Institut Biologique de Lille à Lille 59019
Utilisation de nanoparticules pour le développement de nouvelles thérapies antituberculeuses
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8204-U1019 éq. 07 (CHEMICAL GENOMICS OF INTRACELLULAR MYCOBACTERIA)
directeur de thèse : Priscille BRODIN
 
LILLE 2 (MED)
MUNCK Camille  envoyer un message
mardi 05 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Dosimétrie basée sur l'imagerie pour l'optimisation de la thérapie photodynamique pour le mésothéliome pleural malin
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1189 (THÉRAPIES LASERS ASSISTÉES PAR L'IMAGE ET LA SIMULATION EN ONCOLOGIE (TLAI-ONCO))
directeur de thèse : Serge MORDON
 
LILLE 2 (MED)
TARDIVEL-SAFI Meryem  envoyer un message
mercredi 06 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Les nanotubes, une nouvelle voie de communication cellulaire impliquée dans la propagation neurone-neurone des espèces pathologiques de Tau.
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1172 éq. 01 (ALZHEIMER & TAUOPATHIES)
directeur de thèse : Morvane COLIN
 
USTL (USTL)
POTELLE Sven  envoyer un message
vendredi 08 décembre 2017
(14h00) - Amphithéâtre de l'IRCICA
TMEM165: un nouvel acteur de la régulation de l'homéostasie golgienne du Mn2+, impliqué dans les anomalies congénitales de la glycosylation
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8576 éq. 09 (MÉCANISMES MOLÉCULAIRES DE LA N-GLYCOSYLATION ET PATHOLOGIES ASSOCIÉES )
directeur de thèse : Francois FOULQUIER
 
LILLE 2 (STAPS)
PAWLAK-CHAOUCH Mehdi  envoyer un message
lundi 11 décembre 2017
(13h30) - FSSEP AMPHI 1
La régulation de la perfusion musculaire dépendante du monoxyde d'azote (NO) : effet de l'aptitude aérobie et des facteurs de risques cardiovasculaires liés à la diméthylarginine asymétrique
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA7369 éq. 01 (ACTIVITÉ PHYSIQUE, MUSCLE, SANTÉ (APMS))
directeur de thèse : Serge BERTHOIN
 
USTL (USTL)
DELANNOY Clément  envoyer un message
lundi 11 décembre 2017
(14h00) - USTL Amphithéâtre IRI/IRCICA
Etude structurale des modifications de la glycosylation des macrophages induites par Mycobacterium bovis BCG
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8576 éq. 01 (GLYCOBIOLOGIE STRUCTURALE DES INTERACTION HÔTES-PATHOGÈNES)
directeur de thèse : Elisabeth ELASS-ROCHARD
 
LILLE 2 (MED)
BALDACCI Simon  envoyer un message
mardi 12 décembre 2017
(15h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Conséquences de la dérégulation de MET sur le phénotype tumoral des cancers bronchiques non à petites cellules EGFR mutés devenus résistant aux inhibiteurs de tyrosine kinase d'EGFR
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR CNRS 8161 éq. 05 (SIGNALLING - APOPTOSIS AND CANCER)
directeur de thèse : Alexis CORTOT
 
USTL (USTL)
IAMSHANOVA Oksana  envoyer un message
jeudi 14 décembre 2017
(14h30) - IRI
Role of NALCN channel in prostate cancer metastatic behaviours.
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1003 (LABORATOIRE DE PHYSIOLOGIE CELLULAIRE (PHYCELL))
directeur de thèse : Natalia PREVARSKAYA
 
USTL (USTL)
DELCOURT Vivian  envoyer un message
jeudi 14 décembre 2017
(15h00) - USTL A déterminer Bât SN3 - Salle Pasteur
Development of proteomics-based strategies for the discovery of novel proteins encoded from non-canonical sequences in eukaryotes

The traditional vision of protein synthesis in eukaryotic species involves one messenger RNA (mRNA) bearing a single open reading frame (ORF), also termed coding sequence (CDS). Numerous mRNA isoforms may be produced from each gene by alternative splicing, and some mRNAs may contain different canonical ORF versions. Thus, each eukaryotic coding gene may produce a canonical protein and one or more of its isoforms. The whole pool of such proteins is termed the proteome.

In contrast to this vision, numerous experimental evidences report that eukaryotic proteomes may have been under-evaluated and that cells are capable of synthetizing proteins which had not been predicted. These proteins, termed “alternative proteins” (altProts) may be translated from non-canonical or alternative ORFs (altORFs) localized in mRNAs or in RNAs annotated as non-coding (ncRNA). These altProts are not isoforms of canonical proteins but completely new protein sequences. In mRNAs, altORFs may be localized in 5' or 3' regions, or in regions overlapping the CDS initially predicted by genome annotation but in a frameshifted reading frame. In ncRNAs, altORFs may be localized anywhere in the molecule.

These discoveries were made possible thank to technical progresses in bioanalytics and particularly in mass spectrometry (MS) -based proteomics analyses, which allow large-scale identification of proteins. These analyses are based on two main strategies; the “bottom-up” approach is based on the peptidic products of enzymatic digestion of native proteins whereas the second and more recent approach, termed “top-down”, is based on the analysis of intact protein by MS. Proteins or peptidic products are often separated by a liquid chromatography coupled to a mass spectrometer. Mass spectrometer records “MS” and “MS/MS” spectra of these analytes. MS spectra give information about the molecular weight of the analyte which is present in the sample, more precisely the molecular weight of the intact protein in top-down or peptidic product in bottom-up approaches. MS/MS spectra contain informations regarding amino-acid sequence of analytes. Based on the information found in MS and MS/MS spectra, it is then possible to identify the protein from which the analyte is derived by comparing these spectra to theoretical spectra derived from a protein sequence database. Until recently, only proteins resulting from genome annotation were reported in these databases. It is only recently that altProts have been predicted, allowing their identification.

The work described in this thesis is focused on the development of experimental and bioinformatics strategies helping the discovery and characterization of altProts using bottom-up and top-down approaches, the relative and absolute quantification of these proteins. The findings are described in scientific publications which will be included in the thesis. These publications include a review, two publications on the application of the top-down approach using micro-extractions on rat brain tissue and ovarian tumor biopsy, one publication related to the stoichiometry of a canonical and an alternative protein both encoded in the same gene, and finally, the evaluation of altProts as potential biomarkers.

résumé (français)
Unité de recherche : INSERM U1192 (PROTÉOMIQUE, RÉPONSE INFLAMMATOIRE ET SPECTROMÉTRIE DE MASSE (PRISM))
directeur de thèse : Isabelle FOURNIER
 
LILLE 2 (MED)
CARTON Celine  envoyer un message
vendredi 15 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Rôle oncogénique des fragments de p65/RelA Nf-kB générés par l'activité de RIPK3
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1172 éq. 04 (FACTEURS DE PERSISTANCE DES CELLULES LEUCÉMIQUES)
directeur de thèse : Thierry IDZIOREK
 
LILLE 2 (PHARMA)
MANCHE Monique  envoyer un message
vendredi 15 décembre 2017
(14h00) - Faculté de Pharmacie amphithéâtre Curie
Etude de la toxicité cutanée et respiratoire des alcools dans les produits hydro-alcooliques d'hygiène des mains
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8204-U1019 éq. 10 (LACTIC ACID BACTERIA AND MUCOSAL IMMUNITY)
directeur de thèse : Benoit FOLIGNE
 
LILLE 2 (MED)
FOVET Thomas  envoyer un message
vendredi 15 décembre 2017
(14h00) - Faculté de médecine - Pôle Formation - Salle 3
DÉTECTION AUTOMATISÉE DES HALLUCINATIONS AUDITIVES EN IRM FONCTIONNELLE ET PERSPECTIVES THÉRAPEUTIQUES DANS LA SCHIZOPHRÉNIE
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR-CNRS 9193 éq. 03 (PSYCHIATRIE & CROYANCE (PSYCHIC))
directeur de thèse : Renaud JARDRI
 
LILLE 2 (PHARMA)
DUPLOYEZ Nicolas  envoyer un message
vendredi 15 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
ÉTUDE DES ALTÉRATIONS GÉNOMIQUES ACQUISES DANS LES LEUCÉMIES AI-GUËS MYÉLOÏDES IMPLIQUANT LE CORE BINDING FACTOR
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1172 éq. 04 (FACTEURS DE PERSISTANCE DES CELLULES LEUCÉMIQUES)
directeur de thèse : Claude PREUDHOMME
 
LILLE 2 (MED)
BERTRAND Benoit  envoyer un message
lundi 18 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Formation - Salle des thèses
Cémentochronologie - Précision et exactitude de l'estimation de l'âge au décès Influence de la taphonomie
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA7367 (UNITÉ DE TAPHONOMIE MÉDICO-LÉGALE (UTML))
directeur de thèse : Valery HEDOUIN
 
LILLE 2 (MED)
NDIAYE Fatou Kine  envoyer un message
lundi 18 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Étude post-GWAS des gènes de susceptibilité au diabète de type 2 : rôle phare dans la fonction de la cellule β pancréatique
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR CNRS 8199 éq. 01 (GÉNOMIQUE ET ÉPIGÉNOMIQUE DES MALADIES MÉTABOLIQUES )
directeur de thèse : Amélie BONNEFOND
 
LILLE 2 (MED)
PELLEGRINO Giuliana  envoyer un message
mercredi 20 décembre 2017
(14h30) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
La néogenèse cellulaire dans l'hypothalamus: un nouveau mécanisme de contrôle de la fonction de reproduction?
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : INSERM U1172 éq. 02 (DÉVELOPPEMENT ET PLASTICITÉ DU CERVEAU NEURO-ENDOCRINE)
directeur de thèse : Ariane SHARIF
 
LILLE 2 (MED)
LESAGE Kevin  envoyer un message
mercredi 20 décembre 2017
(13h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Caractérisation fonctionnelle et implication du facteur de transcription TgAP2X-5 dans la régulation des gènes de virulence chez Toxoplasma gondii
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR8204-U1019 éq. 01 (MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY OF TOXOPLASMA GONDII)
directeur de thèse : Mathieu GISSOT
 
LILLE 2 (MED)
BENHABILES Hana  envoyer un message
mercredi 20 décembre 2017
(10h00) - siège de l'université - salle du conseil
Etude de la correction de mutations non sens par de nouvelles molécules pouvant servir d'approches thérapeutiques ciblées.
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR CNRS 8161 éq. 05 (SIGNALLING - APOPTOSIS AND CANCER)
directeur de thèse : Fabrice LEJEUNE
 
LILLE 2 (MED)
CASTRA Laurent  envoyer un message
jeudi 21 décembre 2017
(14h00) - ILIS - Salle du Conseil
Typologie des arrêts cardiaques au regard des inégalités sociales et territoriales de santé en France : application au registre national des arrêts cardiaques (RéAC)
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA2694 (SANTÉ PUBLIQUE : EPIDÉMIOLOGIE ET QUALITÉ DES SOINS)
directeur de thèse : Herve HUBERT
 
USTL (USTL)
DUMORTIER Mandy  envoyer un message
jeudi 21 décembre 2017
(14h00) - amphithéâtre IBL
Etude du rôle des facteurs de transcription ETV4 et ETV1 de la famille ETS dans le processus tumoral de cancers hormono-dépendants : - le cancer du sein - la progression métastatique du cancer de la prostate
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : UMR CNRS 8161 éq. 07 (ETS PROTEINS AND ASSOCIATED DISEASES)
directeur de thèse : Anne CHOTTEAU-LELIEVRE
 
LILLE 2 (MED)
PASCART Tristan  envoyer un message
vendredi 22 décembre 2017
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
Etudes des modifications osseuses de composition et structure dans l'ostéonécrose de tête fémorale et corrélations étiopathogéniques IRM
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA4490 (PHYSIOPATHOLOGIE DES MALADIES OSSEUSES INFLAMMATOIRES)
directeur de thèse : Bernard CORTET
 
ARTOIS
MODELE Doctorant  envoyer un message
lundi 15 janvier 2018
(14h00) - Fac. de Médecine - Pôle Recherche - Salle des thèses
De la difficulté à gérer des étudiants et des enseignants-chercheurs réfractaires dans une ED. Applications dans le domaine de la biologie-santé.
 
résumé (français)
abstract (english)
Unité de recherche : EA7369 éq. 01 (ACTIVITÉ PHYSIQUE, MUSCLE, SANTÉ (APMS))
directeur de thèse : Directeur de thèse MODELE